Estive pensando em uma maneira de evidenciar o efeito da diferença de eletronegatividade em compostos orgânicos. Então fiz alguns testes bastante interessantes (e muito rápidos) usando Avogadro e MOPAC2009. A partir da molécula de metano, foram gerados; metilamina, metanol e fluormetano (seguindo a crescente ordem de eletronegatividade H, N, O e F para o substituinte). Os quatro compostos em questão foram então minimizados no programa MOPAC, usando o método PM6. A figura 1 mostra o mapa de potencial eletrostáticos para os 4 compostos.
Mapa de potencial elestrostático de superfície, para as moleculas; metano, metilamina, metanol e fluormetano. Azul representa um potencial positivo frente a aproximação de um carga pontual positiva (processo que requer energia), e vermelho, potencial negativo. Note o aumento da polarição da região do átomo de carbono frente a crescente eletronegatividade dos substituintes.
A ordem crescente na eletronegatividade do substituinte no metano tem um acentuado efeito na polarição do sistema.
Olá,
ResponderExcluirGostaria de saber se existe alguma diferença do mapa de potencial eletrostático gerado apenas no Avogadro daquele feito o tratamento da modelagem da molécula pelo MOPAC e depois gerado a visualização pelo Avogadro, pois pelo que vi não consegui notar diferença no perfil.
Seu post me ajudo muito no trabalho da universidade! Obrigado e continue com este blog!!
Abraços
Daniel
Olá Daniel,
ResponderExcluirO avogadro eh um software muito bom e a comunidade dele esta crescendo bastante, porem ele ainda é limitado em algumas coisas. Uma delas é justamente essa: ele não importa automaticamente as cargas parciais geradas pelo mopac. creio que para isso, o Gabedit e o Molden são mais eficientes.
VC pode editar as propriedades dos atomos e substituir os valores das cagas uma a uma, mas isso é infernal se vc tem uma molecula grande.